南京医科大学外国语学院可溯源至1934年学校创建时成立的外语教研室。2000年成立大学外语部，2003年设置四年制本科英语专业并开始招生，2006年成立南京医科大学外国语学院，2007年培养出我省英语专业（医学英语方向）首批本科毕业生。
学院现有教职工57，高级职称教师17人，并聘有多名兼职和全职外籍语言教学专家。开设专业英语、医学英语、通用英语以及第二外语（日语、法语）等共20余门课程。
学院设有英语系、大学外语一部、大学外语二部、研究生外语部、医学英语部、全国医护英语水平考试（METS）教研中心以及英语教学实验中心、大学生外语技能实训基地、外语培训中心和英文报（NMU NEWS）编辑部。学院与江苏省和南京市卫健委建立协作关系，为江苏省各地、市主要医院提供外语服务；与美国南卡罗莱纳大学（University of South Carolina）、英国华威大学（University of Warwick）等世界著名高校建立了英语专业学生访学合作项目。
学院秉承“笃学、求实”的院训，深化教育教学改革与创新，围绕“立德树人”总目标，人才培养和社会服务工作取得优异成绩。近三年，全国大学专业英语四级和八级考试一次通过率达97.7%和82%，分别高出全国平均46个和41个百分点；英语专业学生在青年精英亚洲培训营（日本站）比赛、“俄罗斯生态年征文比赛”决赛、“外研社杯”全国英语阅读写作和演讲比赛等重要赛事中取得优异成绩；指导学生获得全国大学生英语竞赛特等奖、首届江苏省大学生跨文化交际能力大赛本科英语组决赛一等奖、第23届“21世纪可口可乐杯”英语演讲大赛江苏省决赛一等奖。大学生英文记者团荣获团中央网络影视中心和未来网“全国学生最具影响力媒体社团”称号。研究生升学率超过30%；一次性就业率连续多年100%。
