南京医科大学药学院成立于2002年，现有药学一级学科博士学位授权点和药学一级学科博士后科研流动站。药学一级学科为江苏省重点学科，在第四轮教育部学科评估中获B等级，并入选江苏高校优势学科三期建设项目。药理学科为国家重点学科，药理毒理学与化学进入ESI数据库全球研究机构排名前1%。药剂与药理学2021QS世界大学排名在独立设置医科大学中排名第一。
学院现有国家“百千万”人才1人、国家优秀青年基金获得者3人、江苏省杰出青年基金获得者4人、江苏省“六大人才高峰”创新团队2个、江苏省“双创团队”1个、江苏省“333工程”培养对象5人（含二层次1人）、江苏省有突出贡献中青年专家1人、江苏特聘教授4人、江苏特聘医学专家1人，江苏省双创人才4人，江苏省“青蓝工程”培养对象4人等。
学院设有8个学系（化学系、临床药学系、临床药理学系、药物化学系、药物分析学系、药剂学系、核药学系、药品监管科学与药物经济学系）、1个研究所（干细胞与神经再生研究所）、2个省级重点实验室（江苏省心脑血管药物重点实验室、江苏省基因药物技术中心）、1个省级实验教学示范中心（江苏省药学综合实验教学示范中心）。
近年来学院承担新药创制科技重大专项、国家自然科学基金重点项目、重大研究计划项目、优秀青年基金、省自然科学基金重点项目、省杰出青年科学基金在内的重大研究20余项，国家自然科学基金面上及青年基金年均10余项。发表SCI论文年均50余篇，包括Nat Med, Circulation, Neuron等国际权威刊物，篇均IF为4.0以上。授权的国内专利年均10项。获教育部自然科学奖一等奖1项、二等奖1项，江苏省科技奖一等奖2项。
学院设有2个本科招生专业：药学与临床药学，均为教育部国家一流专业建设点，其中药学专业于2020年顺利通过国家教育部专业认证。近年来获国家虚拟仿真实验教学项目1项，全国药学专业学位研究生教育教学成果二等奖1项，江苏省教学成果奖二等奖1项。获全国优秀博士学位论文提名1篇、全国药学专业学位研究生优秀学位论文1篇、江苏省优秀博士学位论文3篇、江苏省优秀硕士学位论文8篇、江苏省优秀本科毕业论文16篇。本科生多次获全国药学专业大学生实验技能竞赛、全国大学生药苑论坛特等奖、一等奖等。
学院全体教职工将继续秉承“精诚于人、精心于药”的院训精神，为把我院建成有特色、国内知名的药学院而努力奋斗！
